BIO331_2022

BIO331

View the Project on GitHub vprobon/BIO331_2022

BIO331 - Υπολογιστική και Συστημική Βιολογία

Διδακτικό Υλικό

Σε μεγάλο βαθμό θα ακολουθήσουμε το βιβλίο

Python for the Life Sciences A Gentle Introduction to Python for Life Scientists των Alexander Lancaster και Gordon Webster.

Το βιβλίο είναι προσβάσιμο σε ηλεκτρονική μορφή μέσω της συλλογής της βιβλιοθήκης του Πανεπιστημίου Κύπρου ακολουθώντας το σύνδεσμο: https://doi.org/10.1007/978-1-4842-4523-1.

Μπορείτε να βρείτε τον κώδικα που συνοδεύει το βιβλίο στο αποθετήριο https://amberbiology.github.io/py4lifesci/.

Επιπλέον διδακτικό υλικό και υλικό για εξάσκηση

Στο διαδίκτυο υπάρχει πληθώρα ιστοσελίδων με υλικό σχετικό με το μάθημα. Ένα σχετικά απλό, εισαγωγικό βιβλίο στην Python στοχευμένο σε άτομα που προέρχονται από τις Βιολογικές Επιστήμες είναι το Python for Biologists του Dr Martin Jones, το οποίο διατίθεται ελέυθερα με βάση το Creative Commons Attribution-NonCommercial ShareAlike 3.0 Unported License στο URL: http://userpages.fu-berlin.de/digga/p4b.pdf. Παραδέιγματα και ασκήσεις που συνοδεύουν το συγκεκριμένο βιβλίο μπορείτε να βρείτε στο URL https://pythonforbiologists.com/exercise-files.html.

Ένα άλλο ενδιαφέρον βιβλίο που είναι ελεύθερα προσβάσιμο στο διαδίκτυο είναι το Python for Everbody: Exploring Data in Python3 του Prof. Charles Severance https://www.py4e.com/book.php.

Προαιρετικό υλικό

Εξοικοίωση με το Linux/γραμμή εντολών

The Unix Shell ένα σύντομο tutorial από το Software Carpentry.

The Linux command line for beginners, ένα σύντομο tutorial από το Ubuntu.

Λίγα στοιχεία για την Perl

Εισαγωγή στον προγραμματισμό με τη γλώσσα Perl

Εισαγωγή στο περιβάλλον της R (Coming soon!)